Исправленный вариант:
«Конечно, я согласен, но не уверен в сроках.»
Пояснение:
- «Конечно» здесь — вводное слово (выражает отношение говорящего), оно не является членом предложения и выделяется запятой. Проверка: можно заменить «конечно» на «безусловно/разумеется» — смысл сохраняется, значит это вводное.
- Запятая перед «но» ставится потому, что «но» — противительный сочинительный союз, соединяющий две части предложения («я согласен» и «не уверен в сроках»). Перед такими союзами запятая обязательна.