"Подчёркнула" - это форма прошедшего времени глагола "подчёркнуть", которая используется, когда необходимо выразить действие совершенное в прошлом.

Пример: Она подчёркнула важное слово в тексте.

"Подчёркивала" - это форма прошедшего времени глагола "подчёркивать", которая используется, чтобы описать продолжительное или повторяющееся действие в прошлом.

Пример: В прошлом году она часто подчёркивала слова в тех рефератах.