Использование формы "музеефикация" с буквой "е" обусловлено правилами русского языка. В данном случае, слово образовано от слова "музей" с помощью суффикса "-ификация", который добавляется к корню для образования нового слова. Согласно правилам словообразования, когда корень заканчивается на "е", то после суффикса "и" пишется буква "е" (например, архив - архивизация, театр - театризация).

Таким образом, слово "музеефикация" является правильным и соответствует правилам русского языка. Если вы видели в других текстах форму на букву "и", возможно, это было использовано не совсем правильно или было допущено опечатка.