Вероятно, ваш друг воспринял фразу "скатертью дорога" как намек на то, что ему пора уходить или что он мешает, как скатерть на праздничном столе. Хотя ваш намерение было пожелать ему счастливого пути, но слова могут быть интерпретированы по-разному. Лучше всего объясните свои намерения другу и извинитесь за возможное недоразумение.