Да, в данном предложении нужно поставить запятые: "Книги, как будто, не замечали меня".

Первая запятая ставится перед вводным словом "как будто", выделяя его от основной части предложения. Вторая запятая ставится после этого вводного слова для разделения его от того, что следует за ним.