Предположение: полученный аванс $600000$ руб. включал НДС $20\%$. Частично выполнено работ на сумму (нетто) $400000$ руб.
Журнал проводок (суммы в руб.):
1) Получен аванс и отражён НДС:
Дт $51$ — $600000$
Кт $62.1$ — $500000$ (аванс без НДС)
Кт $68.2$ — $100000$ (НДС с аванса)
2) Отражена выручка и НДС по части выполненных работ $400000$:
Дт $62.1$ — $480000$
Кт $90.1$ — $400000$ (выручка)
Кт $68.2$ — $80000$ (НДС с выполненной части)
3) Остаток обязательств по незавершённым обязательствам (аванс неисполненный):
Остаток по $62.1$: $600000-480000=120000$
(в том числе нетто $500000-400000=100000$ и НДС $100000-80000=20000$)
Итог: выручка признана $400000$, НДС к уплате по выполненной части $80000$, обязательство по неисполненной части $120000$ (в т.ч. НДС $20000$).