Каждый химический элемент имеет свой уникальный набор спектральных линий из-за уникального строения своих атомов. Спектральные линии атомов происходят из различных переходов между энергетическими уровнями электронов в атоме. Уровни энергии электронов в атоме зависят от его электронной конфигурации, которая, в свою очередь, определяется количеством электронов, их орбитальным моментом количества, а также другими квантовыми числами.

Таким образом, поскольку химические элементы имеют разные электронные конфигурации, их атомы имеют различные энергетические уровни, что приводит к уникальным спектральным линиям для каждого элемента. Это позволяет исследователям и химикам определить состав элемента, используя спектральный анализ, и таким образом, спектральные линии являются как своеобразным "отпечатком пальцев" для каждого химического элемента.