Да, между атомами и ионами существует существенная разница.

Определение:

Атом — это основная единица химического элемента, состоящая из ядра, содержащего протоны и нейтроны, и облака электронов, которое окружает ядро. Атом нейтрален, поскольку количество положительно заряженных протонов равно количеству отрицательно заряженных электронов.Ион — это атом $илимолекула$, который потерял или приобрел один или несколько электронов, в результате чего он становится заряженным. Если ион теряет электрон$ы$, он становится положительно заряженным $катион$. Если он приобретает электрон$ы$, он становится отрицательно заряженным $анион$.

Разница в заряде:

Атомы являются нейтральными частицами, тогда как ионы имеют заряд. Это основное различие между ними.

Электронная структура:

Как вы и упомянули, ионы отличаются от атомов количеством электронов. У ионов может быть не только разное количество электронов на внешнем уровне, но и общее количество электронов в целом, что ведет к изменению их химических свойств.

Таким образом, основное различие между атомом и ионом заключается в наличии или отсутствии электрического заряда, а также в количестве электронов в их структуре.