Да, в этом предложении нужна запятая перед прочерком. Это связующий элемент, который отделяет диагноз "лихорадка неясной этиологии, пневмония" от описания процесса доставки пациента на машине скорой медицинской помощи после приема препарата Гентомирокацин.