В данном предложении отсутствие запятой перед "как" связано с тем, что "как" используется в значении "поскольку", "так как" и не вводит сравнительный оборот. В таких случаях не требуется ставить запятую. Ваша фраза звучит так: "Я считаю, причина его отсутствия мелка как порох". Здесь "как" связывает две части предложения, не отделяясь запятой.