Правильный вариант:
«Он сказал, что придёт, но не сказал, когда.»
Пояснение:
- Запятая перед «что» отделяет главное предложение от придаточного (он сказал — что придёт).
- Запятая перед «но» ставится между двумя простыми предложениями в составе сложносочинённого (Он сказал..., но не сказал...).
- Запятая перед «когда» открывает придаточное изъяснительное, которое относится к «не сказал» (не сказал — когда придёт).